Heatmap: Cluster_43 (P. berghei)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Asexual: SRP099925	Asexual, PbSR-MG KO: SRP109709	10 hpi, ab libitum: SRP059210	10 hpi, diet restriction: SRP059210	10 hpi, ab libitum, kin KO: SRP059210	10 hpi, diet restriction, kin KO: SRP059210	16 hpi, WT: ERP004868	16 hpi, CL: ERP004868	Trophozoite, 16 hpi: SRP027529	Schizont, predicted: ERP021229	Schizont, WT: SRP073801	Schizont, 22 hpi: SRP027529	Schizont: ERP004598	Schizont, ap2-g KO: SRP073801	Schizont, ap2-g2 KO: SRP073801	Schizont, ap2-l KO: SRP073801	Schizont, ap2-o KO: SRP073801	Schizont, ap2-o2 KO: SRP073801	Schizont, ap2-o3 KO: SRP073801	Schizont, ap2-o4 KO: SRP073801	Schizont, ap2-sp KO: SRP073801	Schizont, ap2-sp2 KO: SRP073801	Schizont, ap2-sp3 KO: SRP073801	Schizont, PBANKA_131970 KO: SRP073801	Schizont, ppm2 KO: ERP004598	Schizont, ppm5 KO: ERP004598	Gametocyte, WT: SRP073801	Gametocyte: SRP027529	Gametocyte: ERP004598	Gametocyte (male): SRP099925	Gametocyte (female): SRP099925	Gametocyte ap2-o KO: SRP073801	Gametocyte ap2-o2 KO: SRP073801	Gametocyte ap2-o3 KO: SRP073801	Gametocyte, ppm5 KO: ERP004598	Gametocyte (male), PbSR-MG KO: SRP109709	Gametocyte (female), PbSR-MG KO: SRP109709	Ookinete, WT: SRP073801	Ookinete, WT: ERP004740	Ookinete ap2-o KO: SRP073801	Ookinete ap2-o2 KO: SRP073801	Ookinete ap2-o3 KO: SRP073801	Ookinete, mutant: ERP004740
PBANKA_0310800	0.24	0.22	0.86	1.0	0.5	0.39	0.2	0.21	0.56	0.0	0.67	0.31	0.17	0.45	0.5	0.53	0.75	0.93	0.8	0.38	0.33	0.42	0.42	0.48	0.21	0.18	0.26	0.17	0.09	0.17	0.1	0.33	0.3	0.31	0.12	0.18	0.08	0.3	0.17	0.78	0.4	0.28	0.07
PBANKA_0404000	0.04	0.05	0.8	0.82	0.55	0.3	0.02	0.02	0.22	0.02	0.56	0.14	0.04	1.0	0.68	0.47	0.97	0.72	0.68	0.59	0.25	0.32	0.36	0.48	0.04	0.03	0.19	0.08	0.01	0.03	0.01	0.31	0.25	0.22	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.34	0.2	0.03	0.01
PBANKA_0606100 (MiaA)	0.33	0.29	1.0	0.93	0.68	0.6	0.06	0.09	0.61	0.0	0.58	0.32	0.21	0.27	0.43	0.46	0.43	0.63	0.5	0.41	0.35	0.46	0.47	0.52	0.24	0.23	0.36	0.17	0.15	0.13	0.13	0.37	0.2	0.33	0.15	0.08	0.13	0.23	0.04	0.66	0.48	0.34	0.03
PBANKA_0607200	0.19	0.18	0.86	0.53	0.51	0.37	0.06	0.11	0.52	0.0	0.53	0.11	0.06	0.16	0.29	0.38	0.29	1.0	0.6	0.23	0.22	0.33	0.33	0.32	0.05	0.09	0.18	0.17	0.02	0.25	0.08	0.26	0.27	0.23	0.06	0.25	0.04	0.23	0.07	0.43	0.48	0.22	0.03
PBANKA_0612000 (ClpR)	0.22	0.24	1.0	0.7	0.73	0.53	0.09	0.14	0.57	0.0	0.4	0.15	0.08	0.19	0.33	0.37	0.29	0.67	0.5	0.27	0.18	0.32	0.36	0.37	0.1	0.11	0.15	0.09	0.03	0.07	0.03	0.23	0.27	0.06	0.05	0.03	0.03	0.13	0.05	0.35	0.35	0.15	0.01
PBANKA_0621200	0.13	0.09	0.94	1.0	0.64	0.34	0.07	0.04	0.27	0.0	0.43	0.06	0.04	0.58	0.7	0.68	0.55	0.44	0.42	0.27	0.16	0.2	0.22	0.26	0.07	0.05	0.16	0.11	0.02	0.13	0.04	0.23	0.34	0.35	0.02	0.14	0.02	0.25	0.05	0.39	0.55	0.24	0.04
PBANKA_0704600	0.17	0.15	0.81	1.0	0.38	0.42	0.03	0.02	0.93	0.0	0.49	0.49	0.1	0.25	0.29	0.36	0.28	0.54	0.47	0.39	0.32	0.37	0.41	0.46	0.11	0.12	0.27	0.38	0.09	0.07	0.06	0.32	0.27	0.27	0.09	0.04	0.08	0.09	0.02	0.29	0.23	0.1	0.01
PBANKA_0714200 (ClpB1)	0.5	0.54	0.98	0.96	0.54	0.54	0.04	0.08	1.0	0.0	0.41	0.4	0.28	0.11	0.23	0.36	0.25	0.53	0.4	0.29	0.35	0.41	0.46	0.44	0.25	0.31	0.36	0.33	0.33	0.16	0.25	0.39	0.5	0.09	0.28	0.11	0.35	0.11	0.09	0.28	0.35	0.07	0.04
PBANKA_0716100	0.27	0.24	1.0	0.67	0.61	0.37	0.03	0.06	0.91	0.0	0.52	0.15	0.1	0.09	0.18	0.44	0.26	0.65	0.38	0.31	0.42	0.35	0.4	0.44	0.06	0.13	0.33	0.47	0.06	0.21	0.16	0.47	0.6	0.29	0.09	0.2	0.14	0.23	0.03	0.32	0.45	0.19	0.02
PBANKA_0801600	0.03	0.03	0.62	1.0	0.38	0.29	0.03	0.02	0.25	0.0	0.37	0.14	0.04	0.56	0.38	0.25	0.78	0.41	0.44	0.41	0.17	0.18	0.26	0.33	0.05	0.03	0.3	0.11	0.02	0.05	0.02	0.51	0.4	0.45	0.02	0.05	0.01	0.08	0.02	0.23	0.19	0.04	0.02
PBANKA_0807000 (RPB1)	0.37	0.38	0.93	1.0	0.46	0.48	0.11	0.13	0.82	0.0	0.51	0.47	0.28	0.35	0.42	0.5	0.46	0.45	0.49	0.42	0.37	0.48	0.52	0.58	0.32	0.28	0.22	0.34	0.21	0.19	0.16	0.35	0.3	0.23	0.19	0.18	0.19	0.14	0.15	0.45	0.26	0.09	0.06
PBANKA_0822100	0.07	0.07	0.59	0.86	0.42	0.26	0.1	0.09	0.18	0.03	0.48	0.17	0.05	0.8	0.75	0.46	1.0	0.65	0.5	0.6	0.34	0.45	0.48	0.52	0.07	0.05	0.21	0.09	0.02	0.06	0.03	0.31	0.27	0.26	0.03	0.08	0.02	0.33	0.07	0.48	0.38	0.27	0.07
PBANKA_0909900	0.33	0.39	0.78	1.0	0.41	0.39	0.09	0.1	0.48	0.0	0.39	0.45	0.19	0.17	0.34	0.38	0.25	0.42	0.42	0.5	0.28	0.39	0.45	0.51	0.21	0.23	0.24	0.17	0.08	0.37	0.15	0.3	0.39	0.29	0.12	0.47	0.08	0.17	0.06	0.37	0.35	0.14	0.03
PBANKA_0929800	0.32	0.31	1.0	0.96	0.59	0.48	0.17	0.33	0.63	0.0	0.52	0.34	0.11	0.19	0.34	0.55	0.3	0.58	0.51	0.4	0.29	0.43	0.48	0.5	0.12	0.15	0.17	0.14	0.05	0.09	0.05	0.24	0.21	0.12	0.08	0.07	0.05	0.24	0.14	0.84	0.43	0.13	0.06
PBANKA_0943100 (NOT1)	0.25	0.27	1.0	0.95	0.56	0.53	0.03	0.04	0.61	0.0	0.46	0.31	0.1	0.12	0.25	0.4	0.16	0.43	0.42	0.33	0.26	0.37	0.4	0.48	0.1	0.13	0.19	0.13	0.04	0.09	0.05	0.26	0.23	0.15	0.07	0.07	0.05	0.08	0.04	0.44	0.2	0.04	0.01
PBANKA_1022800 (GlyRS)	0.3	0.28	0.99	1.0	0.58	0.63	0.16	0.12	0.55	0.0	0.36	0.2	0.13	0.11	0.23	0.35	0.2	0.49	0.39	0.22	0.21	0.3	0.33	0.34	0.11	0.16	0.12	0.11	0.06	0.1	0.06	0.15	0.12	0.12	0.09	0.08	0.07	0.28	0.15	0.54	0.35	0.15	0.13
PBANKA_1023800	0.1	0.08	0.64	1.0	0.35	0.26	0.04	0.05	0.25	0.01	0.58	0.32	0.07	0.73	0.61	0.47	0.88	0.63	0.66	0.54	0.3	0.33	0.38	0.47	0.1	0.07	0.23	0.11	0.02	0.07	0.03	0.29	0.31	0.3	0.03	0.07	0.03	0.13	0.03	0.38	0.25	0.08	0.03
PBANKA_1036100	0.17	0.14	0.88	1.0	0.61	0.36	0.13	0.12	0.3	0.0	0.71	0.22	0.08	0.5	0.61	0.55	0.77	0.92	0.72	0.5	0.37	0.43	0.45	0.51	0.09	0.09	0.33	0.17	0.07	0.1	0.07	0.45	0.41	0.21	0.08	0.11	0.06	0.28	0.08	0.44	0.4	0.3	0.1
PBANKA_1105000	0.25	0.25	0.89	0.7	0.41	0.38	0.0	0.0	1.0	0.0	0.39	0.61	0.12	0.09	0.12	0.35	0.14	0.56	0.47	0.29	0.19	0.3	0.34	0.42	0.1	0.15	0.08	0.04	0.02	0.11	0.03	0.12	0.29	0.14	0.04	0.08	0.01	0.05	0.0	0.26	0.35	0.06	0.0
PBANKA_1109000	0.23	0.3	0.93	1.0	0.46	0.42	0.05	0.05	0.59	0.0	0.43	0.16	0.13	0.29	0.31	0.38	0.37	0.53	0.46	0.29	0.21	0.28	0.3	0.37	0.15	0.14	0.17	0.16	0.07	0.1	0.06	0.25	0.21	0.12	0.07	0.09	0.06	0.09	0.06	0.34	0.2	0.06	0.02
PBANKA_1120600	0.2	0.25	0.98	1.0	0.59	0.45	0.07	0.11	0.65	0.0	0.5	0.17	0.07	0.2	0.29	0.58	0.29	0.54	0.51	0.52	0.4	0.54	0.56	0.67	0.08	0.09	0.33	0.18	0.04	0.14	0.06	0.52	0.43	0.5	0.06	0.15	0.04	0.18	0.06	0.62	0.41	0.18	0.03
PBANKA_1126900 (PK4)	0.15	0.17	0.86	1.0	0.47	0.4	0.03	0.04	0.46	0.0	0.41	0.33	0.14	0.35	0.34	0.3	0.43	0.42	0.46	0.37	0.19	0.25	0.32	0.39	0.16	0.14	0.18	0.11	0.06	0.15	0.06	0.26	0.25	0.24	0.06	0.16	0.03	0.06	0.03	0.28	0.17	0.03	0.01
PBANKA_1134500	0.13	0.12	1.0	0.98	0.63	0.42	0.06	0.04	0.38	0.0	0.67	0.15	0.04	0.79	0.55	0.49	0.76	0.9	0.82	0.56	0.37	0.41	0.45	0.53	0.05	0.06	0.28	0.11	0.02	0.07	0.04	0.4	0.33	0.34	0.03	0.07	0.03	0.16	0.04	0.62	0.34	0.12	0.05
PBANKA_1138700	0.26	0.27	0.87	0.64	0.48	0.44	0.02	0.02	1.0	0.0	0.44	0.33	0.09	0.12	0.26	0.29	0.22	0.57	0.72	0.24	0.15	0.25	0.32	0.34	0.09	0.11	0.16	0.06	0.04	0.14	0.05	0.18	0.38	0.37	0.04	0.12	0.03	0.06	0.02	0.27	0.19	0.06	0.01
PBANKA_1142100	0.1	0.09	1.0	0.98	0.57	0.4	0.04	0.05	0.27	0.0	0.69	0.34	0.06	0.69	0.72	0.47	0.89	0.83	0.73	0.63	0.41	0.51	0.58	0.7	0.08	0.07	0.33	0.15	0.02	0.05	0.03	0.56	0.45	0.41	0.04	0.05	0.03	0.16	0.05	0.62	0.41	0.15	0.03
PBANKA_1142800	0.41	0.5	0.84	0.78	0.49	0.51	0.15	0.21	1.0	0.0	0.47	0.39	0.25	0.32	0.53	0.51	0.3	0.44	0.54	0.4	0.32	0.47	0.44	0.45	0.34	0.29	0.27	0.23	0.14	0.41	0.18	0.32	0.38	0.42	0.18	0.45	0.09	0.23	0.07	0.57	0.31	0.16	0.04
PBANKA_1145100	0.15	0.14	0.8	1.0	0.42	0.37	0.04	0.09	0.5	0.0	0.45	0.31	0.12	0.32	0.38	0.35	0.54	0.46	0.44	0.42	0.3	0.31	0.39	0.48	0.14	0.13	0.36	0.21	0.08	0.09	0.06	0.68	0.42	0.31	0.08	0.09	0.06	0.12	0.05	0.55	0.26	0.08	0.02
PBANKA_1203300	0.08	0.06	0.95	1.0	0.64	0.4	0.12	0.09	0.27	0.01	0.55	0.1	0.02	0.35	0.36	0.57	0.5	0.85	0.67	0.42	0.23	0.34	0.31	0.4	0.02	0.03	0.17	0.06	0.0	0.05	0.02	0.33	0.38	0.31	0.01	0.05	0.01	0.31	0.11	0.36	0.66	0.23	0.1
PBANKA_1214900	0.24	0.27	1.0	0.76	0.56	0.5	0.29	0.13	0.49	0.0	0.88	0.29	0.2	0.62	0.56	0.73	0.69	0.99	0.89	0.59	0.45	0.62	0.59	0.67	0.22	0.23	0.29	0.16	0.15	0.12	0.09	0.31	0.28	0.4	0.11	0.09	0.09	0.56	0.14	0.54	0.71	0.46	0.15
PBANKA_1218800 (ABCI3)	0.04	0.03	0.68	0.9	0.46	0.3	0.01	0.01	0.12	0.0	0.46	0.06	0.03	0.68	0.58	0.58	1.0	0.61	0.54	0.4	0.18	0.25	0.27	0.34	0.05	0.03	0.22	0.05	0.01	0.04	0.02	0.32	0.37	0.36	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.32	0.22	0.06	0.01
PBANKA_1223000	0.19	0.18	0.67	0.74	0.33	0.3	0.08	0.06	0.76	0.0	0.37	1.0	0.19	0.15	0.26	0.33	0.27	0.36	0.35	0.4	0.24	0.38	0.42	0.51	0.22	0.2	0.09	0.14	0.06	0.09	0.04	0.13	0.12	0.07	0.07	0.06	0.03	0.13	0.1	0.32	0.31	0.08	0.04
PBANKA_1235500	0.1	0.09	1.0	0.93	0.53	0.31	0.01	0.02	0.25	0.0	0.27	0.07	0.03	0.15	0.27	0.22	0.31	0.38	0.3	0.2	0.14	0.2	0.21	0.26	0.03	0.03	0.14	0.05	0.01	0.03	0.01	0.21	0.18	0.04	0.02	0.02	0.02	0.05	0.02	0.37	0.18	0.03	0.01
PBANKA_1301200 (MED31)	0.16	0.14	0.84	0.65	1.0	0.71	0.0	0.01	0.4	0.0	0.29	0.21	0.03	0.11	0.24	0.31	0.23	0.57	0.36	0.23	0.15	0.3	0.31	0.33	0.01	0.05	0.06	0.04	0.0	0.04	0.02	0.15	0.09	0.08	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.27	0.17	0.04	0.0
PBANKA_1304200 (SPP)	0.28	0.27	1.0	0.92	0.51	0.4	0.06	0.06	0.65	0.0	0.45	0.16	0.1	0.27	0.54	0.33	0.47	0.56	0.46	0.3	0.31	0.43	0.48	0.51	0.14	0.13	0.24	0.21	0.06	0.17	0.11	0.3	0.47	0.19	0.09	0.14	0.11	0.23	0.05	0.37	0.63	0.14	0.04
PBANKA_1306800 (SEC7)	0.15	0.17	1.0	0.94	0.5	0.39	0.01	0.01	0.51	0.0	0.47	0.36	0.08	0.19	0.37	0.41	0.28	0.54	0.52	0.39	0.23	0.38	0.46	0.55	0.08	0.09	0.17	0.09	0.02	0.1	0.04	0.24	0.25	0.25	0.04	0.1	0.02	0.06	0.02	0.34	0.19	0.04	0.01
PBANKA_1314100	0.2	0.19	1.0	0.98	0.53	0.43	0.02	0.03	0.61	0.0	0.5	0.2	0.13	0.32	0.38	0.46	0.44	0.56	0.5	0.42	0.35	0.37	0.41	0.48	0.15	0.13	0.39	0.26	0.1	0.1	0.07	0.55	0.4	0.44	0.08	0.11	0.07	0.09	0.03	0.32	0.2	0.08	0.01
PBANKA_1314700	0.19	0.16	0.77	1.0	0.44	0.49	0.13	0.2	0.4	0.0	0.45	0.26	0.12	0.13	0.22	0.38	0.23	0.46	0.41	0.34	0.37	0.37	0.41	0.43	0.12	0.14	0.36	0.25	0.12	0.22	0.13	0.41	0.47	0.37	0.13	0.22	0.11	0.19	0.1	0.42	0.28	0.11	0.05
PBANKA_1332000 (U2AF2)	0.41	0.42	0.96	1.0	0.41	0.47	0.07	0.1	0.92	0.0	0.51	0.49	0.22	0.28	0.42	0.51	0.23	0.42	0.52	0.43	0.3	0.5	0.47	0.53	0.24	0.24	0.18	0.13	0.09	0.27	0.1	0.2	0.21	0.24	0.1	0.23	0.06	0.16	0.03	0.36	0.2	0.09	0.02
PBANKA_1339200	0.1	0.09	0.73	0.61	0.6	0.28	0.08	0.17	0.42	0.0	0.69	0.11	0.06	0.86	0.73	0.51	1.0	0.87	0.7	0.6	0.28	0.38	0.36	0.4	0.06	0.07	0.17	0.14	0.02	0.04	0.02	0.25	0.24	0.13	0.02	0.02	0.02	0.36	0.09	0.59	0.36	0.26	0.06
PBANKA_1346600	0.34	0.3	0.83	1.0	0.54	0.54	0.29	0.53	0.58	0.0	0.33	0.21	0.17	0.08	0.15	0.38	0.14	0.41	0.3	0.25	0.27	0.31	0.33	0.36	0.13	0.21	0.19	0.17	0.13	0.15	0.12	0.24	0.19	0.19	0.19	0.1	0.15	0.24	0.26	0.44	0.31	0.25	0.1
PBANKA_1357200 (GRP170)	0.34	0.35	1.0	0.98	0.49	0.65	0.05	0.1	0.86	0.0	0.38	0.61	0.21	0.2	0.22	0.3	0.32	0.37	0.45	0.34	0.23	0.3	0.37	0.44	0.2	0.22	0.19	0.14	0.1	0.15	0.08	0.22	0.2	0.19	0.12	0.12	0.08	0.1	0.06	0.4	0.23	0.09	0.02
PBANKA_1363800	0.18	0.17	0.99	1.0	0.65	0.53	0.13	0.14	0.48	0.0	0.43	0.17	0.06	0.12	0.35	0.42	0.22	0.47	0.43	0.33	0.35	0.38	0.43	0.49	0.07	0.08	0.37	0.19	0.05	0.1	0.07	0.53	0.44	0.34	0.07	0.11	0.06	0.27	0.12	0.68	0.4	0.15	0.05
PBANKA_1407100	0.41	0.38	0.98	1.0	0.61	0.45	0.09	0.15	0.62	0.0	0.44	0.46	0.14	0.09	0.17	0.43	0.23	0.46	0.31	0.43	0.34	0.47	0.51	0.56	0.14	0.19	0.33	0.22	0.08	0.38	0.14	0.58	0.54	0.54	0.1	0.36	0.07	0.19	0.07	0.47	0.31	0.2	0.04
PBANKA_1434500	0.38	0.34	0.97	1.0	0.53	0.41	0.04	0.07	0.67	0.0	0.7	0.43	0.2	0.33	0.54	0.64	0.43	0.7	0.55	0.56	0.55	0.65	0.64	0.69	0.17	0.26	0.55	0.32	0.09	0.18	0.15	0.62	0.57	0.47	0.17	0.15	0.17	0.23	0.07	0.62	0.43	0.32	0.03
PBANKA_1440900	0.2	0.16	1.0	0.79	0.52	0.46	0.03	0.08	0.45	0.0	0.35	0.2	0.07	0.06	0.13	0.45	0.14	0.48	0.3	0.3	0.22	0.32	0.32	0.35	0.08	0.09	0.26	0.11	0.09	0.31	0.13	0.43	0.57	0.43	0.11	0.31	0.05	0.14	0.03	0.19	0.23	0.15	0.01
PBANKA_1443100	0.22	0.22	0.88	1.0	0.4	0.48	0.0	0.0	0.52	0.0	0.39	0.23	0.09	0.33	0.31	0.36	0.3	0.49	0.43	0.29	0.16	0.28	0.3	0.34	0.11	0.11	0.04	0.04	0.02	0.06	0.02	0.05	0.14	0.05	0.03	0.04	0.02	0.05	0.01	0.21	0.2	0.06	0.0
PBANKA_1446500	0.24	0.22	1.0	0.74	0.52	0.38	0.01	0.01	0.71	0.0	0.29	0.2	0.08	0.1	0.2	0.26	0.18	0.48	0.44	0.19	0.14	0.23	0.26	0.32	0.07	0.09	0.06	0.08	0.02	0.13	0.05	0.13	0.13	0.12	0.03	0.13	0.02	0.03	0.01	0.19	0.11	0.03	0.0
PBANKA_1457600	0.19	0.19	0.94	0.94	0.52	0.48	0.04	0.05	1.0	0.0	0.7	0.49	0.11	0.48	0.45	0.75	0.78	0.66	0.67	0.72	0.29	0.42	0.51	0.6	0.1	0.15	0.32	0.15	0.04	0.09	0.04	0.45	0.6	0.34	0.06	0.05	0.04	0.16	0.03	0.55	0.4	0.09	0.01
PBANKA_1462700 (THO2)	0.07	0.07	0.86	1.0	0.53	0.38	0.11	0.06	0.26	0.0	0.34	0.24	0.04	0.22	0.32	0.36	0.36	0.41	0.33	0.38	0.23	0.33	0.37	0.45	0.05	0.05	0.18	0.08	0.03	0.03	0.02	0.29	0.19	0.15	0.03	0.03	0.02	0.18	0.12	0.42	0.32	0.06	0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)