Heatmap: Cluster_38 (P. berghei)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Asexual: SRP099925
Asexual, PbSR-MG KO: SRP109709
10 hpi, ab libitum: SRP059210
10 hpi, diet restriction: SRP059210
10 hpi, ab libitum, kin KO: SRP059210
10 hpi, diet restriction, kin KO: SRP059210
16 hpi, WT: ERP004868
16 hpi, CL: ERP004868
Trophozoite, 16 hpi: SRP027529
Schizont, predicted: ERP021229
Schizont, WT: SRP073801
Schizont, 22 hpi: SRP027529
Schizont: ERP004598
Schizont, ap2-g KO: SRP073801
Schizont, ap2-g2 KO: SRP073801
Schizont, ap2-l KO: SRP073801
Schizont, ap2-o KO: SRP073801
Schizont, ap2-o2 KO: SRP073801
Schizont, ap2-o3 KO: SRP073801
Schizont, ap2-o4 KO: SRP073801
Schizont, ap2-sp KO: SRP073801
Schizont, ap2-sp2 KO: SRP073801
Schizont, ap2-sp3 KO: SRP073801
Schizont, PBANKA_131970 KO: SRP073801
Schizont, ppm2 KO: ERP004598
Schizont, ppm5 KO: ERP004598
Gametocyte, WT: SRP073801
Gametocyte: SRP027529
Gametocyte: ERP004598
Gametocyte (male): SRP099925
Gametocyte (female): SRP099925
Gametocyte ap2-o KO: SRP073801
Gametocyte ap2-o2 KO: SRP073801
Gametocyte ap2-o3 KO: SRP073801
Gametocyte, ppm5 KO: ERP004598
Gametocyte (male), PbSR-MG KO: SRP109709
Gametocyte (female), PbSR-MG KO: SRP109709
Ookinete, WT: SRP073801
Ookinete, WT: ERP004740
Ookinete ap2-o KO: SRP073801
Ookinete ap2-o2 KO: SRP073801
Ookinete ap2-o3 KO: SRP073801
Ookinete, mutant: ERP004740
0.26 0.31 0.19 0.25 0.71 0.71 0.04 0.03 0.11 0.42 0.5 0.03 0.44 0.11 0.1 0.07 0.2 0.05 0.04 0.12 0.02 0.57 0.6 1.0 0.4 0.14 0.01 0.04 0.08 0.11 0.02 0.02 0.03 0.03 0.04 0.15 0.02 0.08 0.0 0.08 0.09 0.11 0.01
0.26 0.31 0.19 0.25 0.71 0.71 0.04 0.03 0.11 0.42 0.5 0.03 0.44 0.11 0.1 0.07 0.2 0.05 0.04 0.12 0.02 0.57 0.6 1.0 0.4 0.14 0.01 0.04 0.08 0.11 0.02 0.02 0.03 0.03 0.04 0.15 0.02 0.08 0.0 0.08 0.09 0.11 0.01
0.13 0.11 0.4 0.58 0.25 0.22 0.14 0.05 0.19 1.0 0.29 0.08 0.32 0.91 0.64 0.26 0.76 0.26 0.39 0.59 0.2 0.2 0.25 0.29 0.31 0.17 0.13 0.1 0.06 0.08 0.05 0.19 0.19 0.17 0.06 0.07 0.05 0.12 0.04 0.14 0.18 0.05 0.06
0.38 0.29 1.0 0.32 0.72 0.36 0.02 0.05 0.24 0.0 0.18 0.14 0.42 0.51 0.52 0.28 0.29 0.29 0.3 0.37 0.24 0.25 0.25 0.29 0.34 0.36 0.27 0.15 0.18 0.89 0.29 0.46 0.52 0.52 0.2 0.84 0.05 0.11 0.01 0.24 0.21 0.14 0.01
0.72 0.98 0.62 0.74 0.17 0.26 0.0 0.01 0.43 0.0 0.54 0.07 0.53 0.2 0.11 0.51 0.19 0.09 0.05 0.38 0.02 0.12 0.15 0.06 1.0 0.47 0.15 0.07 0.05 0.18 0.06 0.09 0.14 0.19 0.25 0.16 0.03 0.1 0.0 0.1 0.11 0.07 0.0
0.45 0.34 0.87 1.0 0.56 0.36 1.0 0.29 0.89 0.57 0.46 0.16 0.73 0.62 0.5 0.63 0.46 0.28 0.26 0.62 0.31 0.39 0.42 0.38 0.98 0.46 0.08 0.14 0.1 0.19 0.11 0.07 0.16 0.09 0.11 0.14 0.1 0.72 0.73 0.2 0.69 0.29 0.89
0.19 0.13 0.23 0.29 0.16 0.16 0.1 0.15 0.1 0.19 0.49 0.45 0.87 0.8 0.48 0.67 0.67 0.37 0.29 0.83 0.41 0.51 0.54 0.54 1.0 0.81 0.04 0.07 0.04 0.11 0.04 0.04 0.04 0.08 0.08 0.07 0.04 0.08 0.07 0.11 0.13 0.14 0.05
0.23 0.21 0.13 0.14 0.12 0.04 0.29 0.29 0.3 0.0 0.4 0.32 0.71 0.73 1.0 0.01 0.52 0.33 0.0 0.48 0.25 0.0 0.36 0.39 0.67 0.58 0.09 0.08 0.21 0.09 0.07 0.04 0.02 0.01 0.19 0.05 0.07 0.22 0.1 0.33 0.33 0.09 0.08
0.48 0.27 1.0 0.61 0.6 0.6 0.06 0.08 0.68 0.0 0.6 0.2 0.7 0.26 0.56 0.4 0.62 0.79 0.54 0.32 0.12 0.35 0.31 0.26 0.35 0.83 0.07 0.04 0.07 0.22 0.07 0.12 0.07 0.08 0.09 0.1 0.01 0.06 0.01 0.11 0.21 0.04 0.01
PBANKA_0516900 (AdoMetDC/ODC)
0.4 0.38 0.66 0.69 0.31 0.24 0.42 0.19 0.41 1.0 0.34 0.15 0.4 0.7 0.45 0.34 0.66 0.33 0.33 0.56 0.26 0.33 0.39 0.44 0.51 0.27 0.12 0.1 0.1 0.18 0.11 0.16 0.16 0.19 0.11 0.19 0.1 0.39 0.52 0.27 0.4 0.12 0.37
0.26 0.31 0.19 0.25 0.71 0.71 0.04 0.03 0.11 0.42 0.5 0.03 0.44 0.11 0.1 0.07 0.2 0.05 0.04 0.12 0.02 0.57 0.6 1.0 0.4 0.14 0.01 0.04 0.08 0.11 0.02 0.02 0.03 0.03 0.04 0.15 0.02 0.08 0.0 0.08 0.09 0.11 0.01
0.21 0.18 1.0 1.0 0.8 0.96 0.02 0.02 0.27 0.0 0.42 0.09 0.31 0.61 0.58 0.01 0.52 0.39 0.0 0.45 0.16 0.0 0.39 0.37 0.2 0.28 0.09 0.2 0.08 0.14 0.04 0.12 0.15 0.14 0.06 0.03 0.03 0.12 0.04 0.35 0.21 0.06 0.03
0.45 0.38 0.62 0.85 0.7 0.65 0.01 0.01 0.36 0.34 0.31 0.19 0.79 0.95 0.54 0.32 0.71 0.33 0.37 0.46 0.22 0.23 0.26 0.25 1.0 0.45 0.04 0.08 0.13 0.21 0.1 0.04 0.12 0.03 0.1 0.17 0.1 0.03 0.01 0.07 0.1 0.06 0.0
0.27 0.24 0.22 0.27 0.51 1.0 0.01 0.01 0.24 0.0 0.05 0.03 0.04 0.09 0.17 0.26 0.04 0.02 0.04 0.01 0.02 0.04 0.02 0.02 0.07 0.08 0.04 0.13 0.12 0.15 0.03 0.05 0.22 0.05 0.08 0.06 0.01 0.11 0.03 0.11 0.2 0.25 0.0
0.2 0.15 0.13 0.15 0.36 0.44 0.06 0.03 0.1 1.0 0.14 0.0 0.08 0.12 0.18 0.22 0.01 0.07 0.09 0.05 0.02 0.07 0.06 0.06 0.11 0.13 0.01 0.08 0.2 0.08 0.01 0.03 0.07 0.07 0.11 0.05 0.02 0.11 0.02 0.1 0.18 0.23 0.0
PBANKA_0712800 (SNRNP27)
0.14 0.12 0.23 0.39 0.2 0.31 0.05 0.05 0.63 0.0 0.48 0.12 0.31 1.0 0.9 0.21 0.6 0.4 0.63 0.48 0.19 0.2 0.21 0.23 0.39 0.26 0.12 0.14 0.08 0.1 0.04 0.12 0.29 0.08 0.06 0.06 0.04 0.13 0.02 0.19 0.38 0.09 0.02
0.74 0.75 0.67 0.67 0.52 0.69 0.79 0.5 1.0 0.0 0.36 0.25 0.55 0.29 0.59 0.4 0.4 0.38 0.27 0.39 0.19 0.39 0.39 0.33 0.32 0.48 0.06 0.1 0.14 0.27 0.1 0.05 0.08 0.04 0.13 0.16 0.09 0.54 0.34 0.37 0.37 0.27 0.39
0.7 0.65 0.61 0.63 0.48 0.52 0.68 0.42 0.8 0.74 0.48 0.36 0.77 1.0 0.86 0.43 0.63 0.52 0.51 0.46 0.25 0.35 0.35 0.34 0.84 0.56 0.08 0.14 0.18 0.27 0.14 0.09 0.06 0.08 0.19 0.2 0.14 0.34 0.55 0.23 0.2 0.23 0.88
0.3 0.32 0.15 0.17 0.27 0.21 0.4 0.44 0.27 1.0 0.18 0.11 0.67 0.54 0.37 0.11 0.32 0.21 0.23 0.19 0.11 0.11 0.11 0.1 0.7 0.45 0.04 0.11 0.17 0.22 0.12 0.05 0.04 0.04 0.14 0.24 0.11 0.17 0.25 0.18 0.12 0.2 0.41
0.55 0.54 0.62 0.69 0.43 0.38 0.43 0.21 0.96 0.0 0.88 0.5 0.49 0.53 0.71 0.99 0.44 1.0 0.52 0.61 0.45 0.82 0.8 0.7 0.64 0.57 0.12 0.14 0.15 0.18 0.11 0.13 0.19 0.07 0.17 0.14 0.12 0.49 0.17 0.44 0.76 0.39 0.18
0.53 0.53 0.52 0.8 0.39 0.5 0.71 0.67 0.89 0.19 0.44 0.27 0.5 1.0 0.62 0.45 0.67 0.45 0.43 0.48 0.27 0.31 0.34 0.32 0.68 0.41 0.15 0.27 0.14 0.21 0.12 0.17 0.12 0.11 0.14 0.2 0.11 0.58 0.45 0.49 0.39 0.45 0.34
0.65 0.49 0.56 0.59 0.4 0.27 0.2 0.01 1.0 0.0 0.34 0.12 0.3 0.22 0.57 0.37 0.25 0.31 0.22 0.4 0.18 0.34 0.34 0.34 0.38 0.27 0.07 0.14 0.07 0.26 0.08 0.08 0.16 0.13 0.1 0.25 0.04 0.23 0.03 0.2 0.31 0.15 0.04
0.43 0.42 0.28 0.51 0.34 0.73 0.18 0.0 0.74 0.0 0.57 0.2 0.22 0.33 0.5 0.3 0.15 0.25 0.21 0.55 0.3 0.48 0.52 0.36 0.14 1.0 0.15 0.41 0.12 0.1 0.06 0.0 0.49 0.65 0.18 0.12 0.0 0.29 0.04 0.03 0.3 0.34 0.08
0.12 0.13 0.49 0.58 0.41 0.21 0.0 0.0 0.27 0.57 0.53 0.2 0.33 1.0 0.49 0.51 0.82 0.39 0.43 0.86 0.35 0.4 0.42 0.48 0.34 0.19 0.06 0.05 0.03 0.08 0.02 0.07 0.14 0.12 0.03 0.08 0.01 0.05 0.0 0.13 0.2 0.08 0.0
0.79 0.68 0.91 0.86 0.5 0.42 0.19 0.04 1.0 0.0 0.47 0.45 0.39 0.18 0.24 0.69 0.24 0.3 0.22 0.52 0.49 0.7 0.69 0.64 0.53 0.39 0.17 0.24 0.14 0.61 0.26 0.23 0.34 0.27 0.21 0.74 0.12 0.25 0.09 0.29 0.49 0.13 0.12
0.67 0.51 0.69 1.0 0.5 0.4 0.04 0.02 0.58 0.0 0.3 0.07 0.63 0.45 0.47 0.5 0.55 0.21 0.23 0.72 0.28 0.28 0.34 0.35 0.84 0.44 0.14 0.17 0.11 0.47 0.19 0.16 0.22 0.19 0.11 0.48 0.1 0.09 0.02 0.14 0.17 0.1 0.03
0.22 0.17 0.61 0.35 0.37 0.16 0.18 0.13 1.0 0.0 0.62 0.54 0.45 0.76 0.55 0.64 0.77 0.66 0.63 0.63 0.56 0.59 0.67 0.75 0.37 0.41 0.37 0.56 0.21 0.32 0.18 0.58 0.55 0.51 0.29 0.46 0.14 0.27 0.25 0.58 0.5 0.16 0.1
0.65 0.46 0.61 0.87 0.42 0.38 0.22 0.12 0.82 1.0 0.35 0.16 0.43 0.66 0.8 0.2 0.62 0.36 0.35 0.36 0.19 0.26 0.29 0.25 0.74 0.35 0.23 0.26 0.2 0.22 0.16 0.2 0.1 0.04 0.18 0.18 0.18 0.24 0.08 0.16 0.21 0.17 0.08
0.89 1.0 0.33 0.26 0.29 0.19 0.14 0.23 0.68 0.0 0.6 0.52 0.44 0.35 0.8 0.57 0.24 0.57 0.32 0.43 0.35 0.57 0.59 0.44 0.44 0.66 0.35 0.24 0.3 0.22 0.16 0.48 0.57 0.34 0.34 0.15 0.24 0.31 0.05 0.5 0.59 0.37 0.12
0.06 0.06 0.11 0.18 0.06 0.03 0.02 0.01 0.06 0.07 0.3 0.38 0.94 0.28 0.26 0.2 0.34 0.08 0.17 0.57 0.15 0.18 0.23 0.27 1.0 0.4 0.01 0.03 0.05 0.04 0.02 0.02 0.08 0.01 0.04 0.03 0.02 0.03 0.02 0.07 0.12 0.03 0.0
0.19 0.17 0.2 0.3 0.16 0.17 0.22 0.02 0.16 1.0 0.22 0.05 0.52 0.79 0.43 0.2 0.55 0.23 0.33 0.3 0.12 0.12 0.15 0.15 0.64 0.29 0.04 0.04 0.06 0.14 0.05 0.05 0.08 0.05 0.06 0.13 0.03 0.16 0.12 0.08 0.2 0.06 0.29
0.46 0.35 0.64 1.0 0.45 0.65 0.0 0.0 1.0 0.71 0.4 0.13 0.46 1.0 0.86 0.4 0.72 0.36 0.58 0.38 0.18 0.23 0.24 0.23 0.72 0.3 0.02 0.06 0.06 0.26 0.07 0.02 0.04 0.06 0.04 0.21 0.03 0.03 0.0 0.06 0.08 0.05 0.0
0.42 0.38 0.77 1.0 0.62 0.57 0.0 0.01 0.33 0.28 0.22 0.07 0.68 0.73 0.4 0.24 0.8 0.22 0.28 0.29 0.12 0.13 0.16 0.16 0.86 0.38 0.01 0.02 0.05 0.17 0.05 0.01 0.04 0.03 0.04 0.15 0.02 0.02 0.0 0.05 0.07 0.03 0.0
0.23 0.2 0.46 0.36 0.38 0.27 0.14 0.1 1.0 0.05 0.28 0.64 0.31 0.23 0.33 0.35 0.21 0.19 0.22 0.3 0.23 0.32 0.33 0.29 0.36 0.3 0.07 0.28 0.11 0.24 0.09 0.11 0.12 0.12 0.12 0.22 0.07 0.12 0.2 0.23 0.18 0.09 0.13
0.55 0.68 0.4 0.45 0.22 0.29 0.06 0.15 1.0 0.0 0.54 0.34 0.43 0.65 0.44 0.59 0.61 0.62 0.4 0.47 0.36 0.53 0.5 0.43 0.3 0.36 0.1 0.16 0.1 0.34 0.11 0.07 0.12 0.14 0.1 0.33 0.08 0.12 0.04 0.2 0.18 0.3 0.03
0.38 0.38 0.49 0.58 0.31 0.26 0.03 0.07 0.61 1.0 0.37 0.15 0.38 0.44 0.51 0.45 0.5 0.35 0.33 0.49 0.25 0.35 0.34 0.3 0.44 0.29 0.21 0.13 0.14 0.17 0.12 0.13 0.12 0.04 0.12 0.12 0.14 0.07 0.04 0.08 0.09 0.07 0.03
0.26 0.31 0.19 0.25 0.71 0.71 0.04 0.03 0.11 0.42 0.5 0.03 0.44 0.11 0.1 0.07 0.2 0.05 0.04 0.12 0.02 0.57 0.6 1.0 0.4 0.14 0.01 0.04 0.08 0.11 0.02 0.02 0.03 0.03 0.04 0.15 0.02 0.08 0.0 0.08 0.09 0.11 0.01
0.13 0.1 0.22 0.18 0.14 0.1 0.25 0.41 0.21 0.09 0.56 0.34 0.45 1.0 0.63 0.54 0.9 0.58 0.52 0.62 0.47 0.62 0.55 0.55 0.46 0.39 0.26 0.18 0.16 0.39 0.17 0.33 0.37 0.38 0.21 0.44 0.1 0.44 0.23 0.55 0.45 0.29 0.15
0.24 0.19 0.28 0.28 0.16 0.12 0.38 0.42 0.2 0.0 0.44 0.11 0.55 1.0 0.6 0.44 0.73 0.38 0.32 0.6 0.34 0.37 0.4 0.39 0.66 0.4 0.1 0.14 0.08 0.14 0.08 0.12 0.13 0.11 0.1 0.13 0.08 0.42 0.23 0.43 0.44 0.29 0.2
0.13 0.12 0.3 0.39 0.18 0.15 0.02 0.03 0.17 0.7 0.39 0.1 0.35 1.0 0.7 0.33 0.88 0.41 0.51 0.71 0.55 0.31 0.39 0.44 0.34 0.25 0.52 0.6 0.27 0.19 0.31 0.7 0.53 0.42 0.26 0.16 0.36 0.06 0.02 0.15 0.12 0.05 0.01
0.35 0.29 0.52 0.7 0.29 0.35 0.36 0.12 0.42 0.01 0.35 0.12 0.59 0.62 0.54 0.4 0.69 0.27 0.32 0.56 0.2 0.28 0.33 0.33 1.0 0.42 0.08 0.14 0.12 0.18 0.08 0.1 0.13 0.1 0.1 0.16 0.06 0.3 0.23 0.2 0.37 0.17 0.33
0.57 0.53 0.56 0.65 0.32 0.41 0.55 0.62 0.72 0.04 0.38 0.2 0.79 0.65 0.73 0.48 0.58 0.32 0.36 0.58 0.32 0.39 0.41 0.39 1.0 0.55 0.24 0.23 0.23 0.31 0.17 0.23 0.21 0.2 0.19 0.29 0.15 0.37 0.29 0.42 0.23 0.36 0.41
0.18 0.19 0.55 0.6 0.28 0.22 0.32 0.13 0.38 0.06 0.6 0.37 0.26 1.0 0.74 0.59 0.7 0.4 0.48 0.82 0.47 0.58 0.64 0.66 0.31 0.22 0.12 0.15 0.06 0.06 0.04 0.17 0.18 0.09 0.07 0.04 0.05 0.74 0.3 0.72 0.92 0.29 0.29
0.54 0.48 1.0 0.92 0.61 0.59 0.07 0.1 0.59 0.63 0.45 0.07 0.69 0.88 0.54 0.51 0.7 0.41 0.39 0.54 0.28 0.31 0.34 0.3 0.98 0.48 0.16 0.16 0.22 0.48 0.21 0.16 0.22 0.23 0.18 0.48 0.13 0.14 0.04 0.18 0.21 0.17 0.04
0.35 0.28 0.44 0.43 0.26 0.31 0.06 0.06 0.35 0.11 0.43 0.26 0.67 1.0 0.73 0.43 0.66 0.46 0.44 0.38 0.23 0.38 0.37 0.31 0.55 0.57 0.18 0.13 0.33 0.18 0.11 0.14 0.18 0.1 0.26 0.14 0.12 0.08 0.02 0.12 0.14 0.11 0.02
0.45 0.41 0.83 1.0 0.49 0.39 0.08 0.05 0.68 0.0 0.55 0.35 0.31 0.24 0.28 0.97 0.35 0.34 0.28 0.79 0.58 0.86 0.86 0.87 0.26 0.34 0.18 0.29 0.06 0.26 0.1 0.25 0.24 0.2 0.11 0.26 0.08 0.16 0.04 0.36 0.4 0.24 0.02
0.13 0.13 0.3 0.33 0.16 0.13 0.22 0.24 0.22 0.24 0.43 0.21 0.15 1.0 0.62 0.41 0.82 0.46 0.44 0.62 0.34 0.39 0.39 0.39 0.16 0.13 0.11 0.1 0.02 0.11 0.05 0.12 0.15 0.14 0.04 0.14 0.03 0.19 0.09 0.34 0.21 0.18 0.05
0.27 0.24 0.52 0.66 0.34 0.27 0.08 0.07 0.7 0.56 0.42 0.92 0.34 0.69 0.58 0.45 1.0 0.31 0.51 0.53 0.3 0.39 0.49 0.55 0.44 0.27 0.13 0.2 0.07 0.2 0.11 0.2 0.21 0.2 0.09 0.29 0.06 0.11 0.17 0.27 0.22 0.06 0.1
PBANKA_1433900 (AP2-MU)
0.39 0.31 0.51 0.37 0.33 0.16 0.38 0.44 0.55 0.0 0.62 0.92 0.49 0.49 0.48 0.83 0.55 0.41 0.36 1.0 0.94 0.84 0.88 0.81 0.54 0.55 0.44 0.63 0.08 0.33 0.24 0.44 0.59 0.48 0.22 0.38 0.21 0.43 0.32 0.63 0.49 0.42 0.24
0.61 0.58 0.49 0.43 0.27 0.21 0.1 0.1 0.68 0.0 0.55 0.43 0.93 1.0 0.73 0.51 0.86 0.48 0.47 0.67 0.44 0.52 0.56 0.53 1.0 0.63 0.16 0.2 0.23 0.58 0.27 0.18 0.39 0.22 0.26 0.61 0.16 0.16 0.05 0.25 0.47 0.19 0.02
0.4 0.39 0.13 0.12 0.07 0.09 0.16 0.15 0.51 0.41 0.28 0.22 1.0 0.61 0.43 0.29 0.41 0.29 0.39 0.26 0.22 0.22 0.21 0.19 1.0 0.73 0.04 0.22 0.17 0.26 0.14 0.03 0.07 0.06 0.2 0.26 0.12 0.08 0.07 0.12 0.08 0.03 0.05
0.54 0.45 0.46 0.44 0.26 0.26 0.82 1.0 0.61 0.0 0.31 0.1 0.4 0.43 0.36 0.35 0.37 0.25 0.24 0.41 0.23 0.24 0.26 0.24 0.45 0.35 0.12 0.12 0.04 0.19 0.09 0.12 0.08 0.15 0.07 0.13 0.09 0.63 0.5 0.47 0.36 0.5 0.55
0.02 0.01 0.04 0.05 0.04 0.02 0.04 0.04 0.0 0.41 0.31 0.05 0.76 1.0 0.62 0.22 0.78 0.26 0.28 0.68 0.18 0.2 0.25 0.26 0.66 0.34 0.02 0.02 0.06 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.03 0.03 0.03 0.04 0.04 0.03 0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)