Heatmap: Cluster_33 (P. berghei)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Asexual: SRP099925	Asexual, PbSR-MG KO: SRP109709	10 hpi, ab libitum: SRP059210	10 hpi, diet restriction: SRP059210	10 hpi, ab libitum, kin KO: SRP059210	10 hpi, diet restriction, kin KO: SRP059210	16 hpi, WT: ERP004868	16 hpi, CL: ERP004868	Trophozoite, 16 hpi: SRP027529	Schizont, predicted: ERP021229	Schizont, WT: SRP073801	Schizont, 22 hpi: SRP027529	Schizont: ERP004598	Schizont, ap2-g KO: SRP073801	Schizont, ap2-g2 KO: SRP073801	Schizont, ap2-l KO: SRP073801	Schizont, ap2-o KO: SRP073801	Schizont, ap2-o2 KO: SRP073801	Schizont, ap2-o3 KO: SRP073801	Schizont, ap2-o4 KO: SRP073801	Schizont, ap2-sp KO: SRP073801	Schizont, ap2-sp2 KO: SRP073801	Schizont, ap2-sp3 KO: SRP073801	Schizont, PBANKA_131970 KO: SRP073801	Schizont, ppm2 KO: ERP004598	Schizont, ppm5 KO: ERP004598	Gametocyte, WT: SRP073801	Gametocyte: SRP027529	Gametocyte: ERP004598	Gametocyte (male): SRP099925	Gametocyte (female): SRP099925	Gametocyte ap2-o KO: SRP073801	Gametocyte ap2-o2 KO: SRP073801	Gametocyte ap2-o3 KO: SRP073801	Gametocyte, ppm5 KO: ERP004598	Gametocyte (male), PbSR-MG KO: SRP109709	Gametocyte (female), PbSR-MG KO: SRP109709	Ookinete, WT: SRP073801	Ookinete, WT: ERP004740	Ookinete ap2-o KO: SRP073801	Ookinete ap2-o2 KO: SRP073801	Ookinete ap2-o3 KO: SRP073801	Ookinete, mutant: ERP004740
PBANKA_0103700	0.56	0.58	0.33	0.21	0.32	0.38	0.09	0.14	1.0	0.0	0.11	0.22	0.25	0.02	0.07	0.14	0.04	0.09	0.09	0.06	0.09	0.12	0.14	0.12	0.17	0.31	0.18	0.33	0.28	0.4	0.23	0.22	0.11	0.14	0.24	0.27	0.18	0.16	0.08	0.34	0.14	0.27	0.07
PBANKA_0208200	0.65	0.67	0.11	0.17	0.09	0.19	0.56	1.0	0.38	0.0	0.17	0.62	0.71	0.05	0.1	0.27	0.06	0.16	0.11	0.19	0.15	0.26	0.24	0.25	0.61	0.8	0.11	0.16	0.37	0.59	0.36	0.13	0.08	0.13	0.36	0.65	0.24	0.24	0.3	0.21	0.19	0.23	0.2
PBANKA_0306300 (MTR3)	0.81	0.89	0.32	0.24	0.29	0.28	1.0	0.95	0.81	0.0	0.23	0.37	0.51	0.04	0.09	0.25	0.04	0.22	0.12	0.12	0.11	0.2	0.2	0.16	0.45	0.63	0.06	0.08	0.17	0.35	0.17	0.04	0.04	0.02	0.17	0.18	0.13	0.55	0.85	0.45	0.34	0.6	0.92
PBANKA_0310000 (SIS1)	0.47	0.45	0.45	0.45	0.4	0.36	0.95	0.77	0.62	0.0	0.2	0.36	0.27	0.05	0.09	0.24	0.07	0.24	0.13	0.13	0.14	0.24	0.22	0.2	0.24	0.31	0.07	0.11	0.13	0.3	0.13	0.09	0.08	0.1	0.15	0.27	0.07	0.62	0.95	0.19	0.42	0.5	1.0
PBANKA_0311100 (mRPL13)	0.91	1.0	0.41	0.29	0.61	0.56	0.7	0.86	0.88	0.0	0.38	0.49	0.54	0.1	0.2	0.51	0.12	0.4	0.27	0.26	0.33	0.47	0.41	0.4	0.44	0.64	0.27	0.23	0.28	0.87	0.36	0.34	0.33	0.39	0.4	0.89	0.25	0.53	0.53	0.51	0.5	0.58	0.45
PBANKA_0401900 (RPB6)	0.77	0.72	0.35	0.33	0.43	0.31	0.83	0.97	1.0	0.0	0.25	0.67	0.59	0.18	0.21	0.36	0.18	0.24	0.19	0.3	0.29	0.31	0.29	0.28	0.85	0.56	0.3	0.66	0.5	0.72	0.5	0.4	0.34	0.44	0.55	0.7	0.44	0.34	0.49	0.54	0.33	0.62	0.32
PBANKA_0405100 (EMC5)	0.93	0.97	0.22	0.21	0.42	0.42	0.65	1.0	0.6	0.0	0.34	0.71	0.94	0.13	0.24	0.36	0.11	0.34	0.21	0.26	0.29	0.32	0.29	0.27	0.71	0.99	0.25	0.34	0.77	0.43	0.5	0.19	0.19	0.09	0.67	0.3	0.66	0.61	0.6	0.25	0.43	0.74	0.42
PBANKA_0407900	0.64	0.58	0.34	0.3	0.31	0.27	0.56	0.98	0.52	0.0	0.6	0.87	0.61	0.21	0.37	0.74	0.27	0.53	0.33	0.47	0.55	0.75	0.65	0.59	0.72	0.74	0.29	0.31	0.3	0.94	0.43	0.33	0.3	0.36	0.41	1.0	0.27	0.61	0.38	0.72	0.5	0.73	0.22
PBANKA_0414800	0.79	0.8	0.55	0.64	0.45	0.65	1.0	0.54	0.71	0.0	0.21	0.14	0.26	0.12	0.25	0.27	0.12	0.22	0.14	0.15	0.2	0.24	0.25	0.21	0.2	0.28	0.2	0.16	0.32	0.3	0.21	0.2	0.13	0.09	0.24	0.27	0.23	0.75	0.8	0.66	0.53	0.25	0.72
PBANKA_0418300 (RER1)	0.38	0.32	0.19	0.15	0.14	0.14	0.36	0.51	0.37	0.0	0.19	0.57	0.45	0.06	0.1	0.25	0.1	0.14	0.1	0.22	0.3	0.31	0.28	0.26	0.51	0.45	0.26	0.31	0.35	0.94	0.45	0.19	0.2	0.21	0.41	1.0	0.34	0.29	0.2	0.26	0.25	0.41	0.14
PBANKA_0601800	0.62	0.64	0.22	0.3	0.21	0.13	0.95	1.0	0.34	0.0	0.22	0.14	0.49	0.05	0.08	0.33	0.05	0.16	0.13	0.13	0.19	0.28	0.28	0.22	0.3	0.51	0.29	0.16	0.42	0.32	0.26	0.15	0.12	0.1	0.36	0.17	0.3	0.76	0.65	0.74	0.59	0.87	0.78
PBANKA_0607100 (TIM10)	0.76	1.0	0.43	0.23	0.53	0.5	0.6	0.71	0.7	0.0	0.33	0.32	0.55	0.03	0.12	0.33	0.05	0.29	0.19	0.17	0.25	0.32	0.32	0.23	0.36	0.73	0.2	0.2	0.55	0.8	0.49	0.23	0.16	0.13	0.65	0.66	0.4	0.39	0.36	0.65	0.32	0.42	0.22
PBANKA_0614100	0.78	1.0	0.2	0.14	0.36	0.28	0.33	0.47	0.64	0.0	0.22	0.57	0.78	0.08	0.16	0.27	0.06	0.19	0.15	0.18	0.12	0.25	0.22	0.23	0.75	0.95	0.06	0.09	0.23	0.43	0.17	0.05	0.08	0.11	0.28	0.29	0.13	0.11	0.11	0.16	0.24	0.26	0.1
PBANKA_0622700	0.87	1.0	0.24	0.27	0.43	0.38	0.05	0.05	0.87	0.0	0.17	0.83	0.66	0.05	0.07	0.24	0.05	0.18	0.11	0.12	0.1	0.19	0.18	0.16	0.6	0.82	0.05	0.13	0.18	0.34	0.15	0.04	0.03	0.05	0.24	0.23	0.14	0.04	0.04	0.1	0.07	0.12	0.02
PBANKA_0706900 (TOM7)	1.0	0.92	0.34	0.46	0.49	0.61	0.16	0.19	0.13	0.0	0.4	0.17	0.76	0.07	0.11	0.7	0.09	0.3	0.14	0.2	0.41	0.45	0.44	0.36	0.52	0.89	0.37	0.09	0.7	0.95	0.76	0.37	0.25	0.32	0.64	0.56	0.59	0.34	0.16	0.43	0.29	0.65	0.11
PBANKA_0708900	0.8	1.0	0.14	0.16	0.33	0.3	0.84	0.81	0.32	0.0	0.25	0.28	0.58	0.13	0.13	0.28	0.11	0.33	0.22	0.13	0.19	0.25	0.21	0.19	0.45	0.68	0.15	0.18	0.54	0.69	0.47	0.16	0.08	0.1	0.47	0.62	0.44	0.37	0.46	0.43	0.39	0.46	0.35
PBANKA_0710900 (LSM3)	0.9	1.0	0.29	0.22	0.43	0.42	0.57	0.78	0.94	0.0	0.27	0.71	0.44	0.07	0.13	0.32	0.09	0.29	0.19	0.2	0.22	0.33	0.28	0.29	0.32	0.54	0.16	0.22	0.26	0.51	0.29	0.18	0.12	0.19	0.3	0.63	0.33	0.47	0.7	0.52	0.48	0.62	0.73
PBANKA_0721300 (GOT1)	0.6	0.56	0.24	0.21	0.29	0.3	0.37	0.47	0.9	0.0	0.25	1.0	0.38	0.13	0.11	0.25	0.19	0.23	0.13	0.28	0.3	0.27	0.28	0.23	0.42	0.51	0.16	0.47	0.08	0.73	0.33	0.16	0.21	0.2	0.25	0.65	0.25	0.32	0.3	0.36	0.31	0.47	0.17
PBANKA_0806500	0.89	1.0	0.76	0.43	0.46	0.49	0.47	0.93	0.93	0.0	0.32	0.14	0.34	0.05	0.15	0.33	0.08	0.34	0.25	0.15	0.24	0.28	0.28	0.24	0.19	0.43	0.3	0.26	0.45	0.63	0.46	0.28	0.18	0.25	0.44	0.77	0.42	0.34	0.23	0.3	0.22	0.49	0.18
PBANKA_0922800 (SNRPD1)	0.78	0.83	0.42	0.37	0.32	0.35	0.8	0.69	0.78	0.38	0.19	0.33	0.4	0.04	0.1	0.26	0.05	0.16	0.13	0.17	0.21	0.25	0.25	0.21	0.33	0.47	0.2	0.18	0.34	0.46	0.23	0.19	0.19	0.23	0.33	0.44	0.21	0.36	1.0	0.52	0.34	0.46	0.98
PBANKA_0924600	0.83	1.0	0.22	0.2	0.28	0.39	0.71	0.89	0.63	0.0	0.12	0.12	0.35	0.02	0.09	0.23	0.02	0.11	0.09	0.06	0.12	0.14	0.15	0.11	0.2	0.45	0.17	0.14	0.36	0.34	0.28	0.09	0.05	0.06	0.34	0.17	0.29	0.18	0.3	0.27	0.06	0.21	0.16
PBANKA_0939400	0.4	0.42	0.32	0.24	0.34	0.32	0.74	0.41	0.42	0.0	0.23	0.36	0.29	0.05	0.1	0.31	0.05	0.2	0.13	0.18	0.17	0.22	0.21	0.2	0.24	0.32	0.15	0.11	0.23	0.28	0.13	0.11	0.06	0.1	0.17	0.33	0.14	0.4	0.52	0.23	0.25	0.39	1.0
PBANKA_0941100	0.31	0.31	0.32	0.33	0.23	0.21	0.79	0.39	0.25	0.0	0.13	0.2	0.2	0.03	0.07	0.2	0.05	0.08	0.08	0.15	0.17	0.21	0.19	0.19	0.22	0.22	0.09	0.08	0.14	0.27	0.15	0.1	0.09	0.09	0.16	0.24	0.11	0.52	0.75	0.24	0.38	0.33	1.0
PBANKA_1011300 (SPC1)	0.57	0.59	0.36	0.31	0.34	0.43	0.22	0.38	0.4	0.0	0.26	0.19	0.33	0.07	0.1	0.29	0.13	0.32	0.21	0.24	0.25	0.29	0.29	0.3	0.28	0.37	0.23	0.11	0.21	0.91	0.32	0.31	0.33	0.36	0.27	1.0	0.11	0.32	0.23	0.24	0.36	0.21	0.2
PBANKA_1017700 (QCR6)	0.57	0.65	0.13	0.11	0.22	0.2	0.26	0.43	0.43	0.0	0.23	1.0	0.57	0.06	0.13	0.29	0.08	0.18	0.14	0.24	0.24	0.33	0.28	0.29	0.53	0.67	0.11	0.23	0.31	0.35	0.26	0.13	0.08	0.11	0.43	0.33	0.31	0.23	0.25	0.13	0.18	0.25	0.23
PBANKA_1027900 (SMB1)	0.77	0.76	0.58	0.43	0.52	0.59	0.86	1.0	0.72	0.24	0.26	0.3	0.47	0.12	0.25	0.39	0.11	0.2	0.21	0.2	0.18	0.27	0.29	0.26	0.48	0.52	0.14	0.15	0.29	0.25	0.2	0.1	0.06	0.17	0.28	0.18	0.19	0.49	0.9	0.5	0.37	0.87	0.88
PBANKA_1111300 (CGI121)	0.9	0.95	0.4	0.24	0.3	0.38	0.53	0.88	0.94	0.0	0.54	0.49	0.76	0.23	0.31	0.7	0.25	0.46	0.33	0.32	0.63	0.58	0.54	0.51	0.6	0.88	0.3	0.54	0.27	1.0	0.45	0.31	0.37	0.68	0.51	1.0	0.27	0.45	0.47	0.49	0.55	0.71	0.34
PBANKA_1131000	0.67	0.69	0.3	0.27	0.22	0.24	0.66	0.41	0.29	0.0	0.32	0.38	0.52	0.06	0.12	0.45	0.09	0.24	0.15	0.28	0.3	0.43	0.37	0.34	0.51	0.62	0.16	0.1	0.32	0.86	0.41	0.18	0.19	0.22	0.42	1.0	0.2	0.43	0.34	0.53	0.44	0.46	0.36
PBANKA_1132100 (SF3B5)	1.0	0.85	0.37	0.31	0.57	0.33	0.85	0.81	0.35	0.0	0.24	0.28	0.62	0.07	0.14	0.35	0.1	0.16	0.13	0.18	0.29	0.33	0.26	0.3	0.64	0.71	0.28	0.22	0.61	0.65	0.63	0.39	0.19	0.34	0.59	0.57	0.62	0.72	0.68	0.72	0.42	0.83	0.6
PBANKA_1141800	0.86	0.87	0.17	0.2	0.18	0.27	0.83	0.79	0.54	0.0	0.18	0.15	0.38	0.07	0.18	0.19	0.23	0.25	0.18	0.13	0.11	0.2	0.15	0.17	0.46	0.39	0.11	0.06	0.17	0.27	0.13	0.11	0.1	0.11	0.24	0.28	0.12	0.81	0.87	0.91	0.87	1.0	0.55
PBANKA_1201700 (ARD1)	0.41	0.34	0.32	0.29	0.23	0.34	0.88	1.0	0.45	0.0	0.18	0.15	0.33	0.09	0.1	0.19	0.1	0.17	0.12	0.14	0.23	0.17	0.16	0.13	0.52	0.34	0.33	0.49	0.57	0.4	0.45	0.31	0.28	0.32	0.5	0.37	0.56	0.31	0.34	0.28	0.38	0.46	0.59
PBANKA_1209300	0.54	0.52	0.35	0.17	0.22	0.18	0.06	0.18	0.61	0.0	0.24	0.29	0.22	0.03	0.07	0.35	0.11	0.22	0.18	0.2	0.23	0.27	0.28	0.24	0.16	0.3	0.25	0.13	0.11	0.99	0.34	0.32	0.39	0.57	0.25	1.0	0.07	0.25	0.05	0.24	0.32	0.47	0.04
PBANKA_1210300 (HO)	0.42	0.43	0.2	0.15	0.13	0.11	0.13	0.22	0.34	0.0	0.24	0.33	0.25	0.05	0.08	0.31	0.08	0.19	0.14	0.2	0.25	0.29	0.25	0.23	0.2	0.33	0.21	0.15	0.14	0.86	0.39	0.23	0.27	0.35	0.27	1.0	0.14	0.21	0.09	0.23	0.36	0.5	0.06
PBANKA_1220000	0.53	0.6	0.18	0.13	0.13	0.18	0.26	0.55	0.5	0.0	0.25	0.34	0.19	0.03	0.08	0.31	0.07	0.19	0.12	0.18	0.33	0.31	0.26	0.26	0.11	0.25	0.31	0.23	0.07	0.82	0.44	0.32	0.29	0.36	0.26	1.0	0.22	0.28	0.18	0.35	0.29	0.42	0.14
PBANKA_1222400	0.51	0.54	0.39	0.29	0.32	0.34	0.24	0.3	0.86	0.0	0.24	0.67	0.31	0.04	0.14	0.31	0.11	0.22	0.23	0.2	0.29	0.3	0.3	0.28	0.27	0.37	0.25	0.47	0.23	0.92	0.4	0.28	0.33	0.42	0.34	1.0	0.18	0.39	0.25	0.39	0.49	0.58	0.16
PBANKA_1223600	0.92	1.0	0.27	0.24	0.5	0.46	0.24	0.19	0.75	0.0	0.37	0.44	0.61	0.21	0.19	0.33	0.11	0.38	0.25	0.22	0.2	0.31	0.28	0.27	0.38	0.77	0.08	0.07	0.15	0.61	0.24	0.08	0.09	0.17	0.21	0.5	0.16	0.32	0.15	0.26	0.34	0.41	0.08
PBANKA_1228000 (1-CysPxn)	0.78	0.71	0.58	0.54	0.72	0.8	0.91	1.0	0.46	0.0	0.16	0.15	0.21	0.05	0.13	0.17	0.07	0.2	0.11	0.1	0.14	0.16	0.15	0.12	0.21	0.25	0.21	0.17	0.48	0.33	0.25	0.17	0.19	0.08	0.35	0.23	0.27	0.58	0.62	0.54	0.3	0.54	0.38
PBANKA_1242600 (UMP1)	0.95	1.0	0.37	0.3	0.4	0.47	0.81	0.76	0.73	0.0	0.26	0.48	0.56	0.04	0.13	0.37	0.06	0.29	0.18	0.19	0.21	0.3	0.27	0.27	0.34	0.68	0.1	0.17	0.33	0.41	0.28	0.08	0.09	0.07	0.45	0.3	0.32	0.3	0.54	0.19	0.23	0.3	0.91
PBANKA_1310900	0.59	0.6	0.32	0.39	0.6	0.53	1.0	0.78	0.87	0.0	0.23	0.53	0.54	0.14	0.31	0.23	0.19	0.22	0.19	0.24	0.21	0.25	0.26	0.21	0.71	0.61	0.24	0.32	0.35	0.57	0.25	0.3	0.29	0.28	0.31	0.37	0.18	0.42	0.4	0.48	0.38	0.37	0.83
PBANKA_1311100	0.79	1.0	0.21	0.18	0.45	0.36	0.3	0.39	0.72	0.0	0.18	0.24	0.51	0.03	0.05	0.24	0.03	0.2	0.09	0.12	0.15	0.25	0.24	0.2	0.4	0.62	0.07	0.07	0.2	0.65	0.19	0.11	0.06	0.08	0.33	0.61	0.05	0.14	0.12	0.21	0.25	0.24	0.1
PBANKA_1311200	0.53	0.47	0.29	0.4	0.24	0.41	1.0	0.9	0.46	0.0	0.18	0.08	0.29	0.03	0.11	0.25	0.05	0.23	0.11	0.08	0.17	0.19	0.21	0.17	0.16	0.32	0.31	0.24	0.44	0.52	0.32	0.21	0.16	0.13	0.37	0.37	0.25	0.58	0.56	0.55	0.39	0.69	0.71
PBANKA_1327800	0.6	0.55	0.25	0.34	0.48	0.36	0.62	1.0	0.41	0.0	0.16	0.2	0.61	0.13	0.15	0.16	0.13	0.16	0.12	0.13	0.16	0.14	0.13	0.13	0.75	0.57	0.17	0.27	0.48	0.55	0.53	0.27	0.17	0.21	0.4	0.6	0.38	0.21	0.46	0.31	0.12	0.2	0.61
PBANKA_1331000	0.71	0.67	0.37	0.32	0.4	0.29	0.39	0.54	0.73	0.0	0.35	0.26	0.5	0.07	0.15	0.4	0.1	0.32	0.19	0.21	0.31	0.39	0.35	0.33	0.34	0.58	0.2	0.27	0.43	0.83	0.38	0.41	0.24	0.31	0.52	1.0	0.23	0.34	0.19	0.61	0.25	0.53	0.24
PBANKA_1331800 (DER1-1)	0.6	0.64	0.17	0.1	0.13	0.1	0.5	0.76	0.5	0.0	0.26	0.8	0.64	0.1	0.2	0.36	0.1	0.15	0.15	0.3	0.33	0.46	0.42	0.38	0.6	0.73	0.23	0.2	0.4	0.83	0.42	0.26	0.27	0.29	0.46	1.0	0.23	0.28	0.17	0.39	0.32	0.37	0.09
PBANKA_1333200 (ATG12)	0.67	0.67	0.25	0.17	0.19	0.2	0.1	0.41	0.33	0.0	0.33	0.24	0.34	0.03	0.06	0.42	0.07	0.22	0.12	0.21	0.33	0.35	0.32	0.27	0.25	0.45	0.3	0.33	0.12	0.78	0.48	0.34	0.31	0.31	0.33	1.0	0.37	0.15	0.1	0.23	0.23	0.35	0.01
PBANKA_1333600 (MPC2)	0.61	0.68	0.22	0.14	0.14	0.15	0.33	0.8	0.29	0.04	0.39	0.59	0.77	0.15	0.29	0.51	0.21	0.3	0.22	0.36	0.5	0.56	0.51	0.5	0.74	0.85	0.24	0.22	0.5	0.75	0.55	0.3	0.25	0.21	0.59	1.0	0.43	0.33	0.2	0.48	0.33	0.32	0.12
PBANKA_1335300 (YIP1)	0.61	0.65	0.21	0.21	0.17	0.15	0.46	0.78	0.6	0.0	0.36	0.71	0.39	0.08	0.19	0.43	0.09	0.2	0.17	0.37	0.33	0.45	0.39	0.38	0.38	0.47	0.23	0.26	0.23	0.7	0.38	0.25	0.29	0.3	0.26	1.0	0.2	0.49	0.22	0.45	0.43	0.41	0.19
PBANKA_1338000	0.82	0.92	0.23	0.23	0.34	0.4	0.49	0.9	0.53	0.0	0.26	0.22	0.65	0.04	0.07	0.34	0.07	0.25	0.14	0.18	0.35	0.3	0.28	0.22	0.43	0.79	0.26	0.48	0.5	1.0	0.8	0.3	0.24	0.26	0.9	0.8	0.67	0.27	0.5	0.59	0.42	0.42	0.4
PBANKA_1404600	0.55	0.54	0.25	0.31	0.29	0.47	0.17	0.27	0.72	0.0	0.3	0.2	0.36	0.03	0.09	0.42	0.05	0.32	0.22	0.17	0.24	0.3	0.29	0.24	0.21	0.46	0.19	0.15	0.21	0.7	0.34	0.16	0.12	0.11	0.29	1.0	0.22	0.27	0.12	0.48	0.39	0.31	0.1
PBANKA_1421800	0.89	1.0	0.25	0.22	0.23	0.2	0.19	0.42	0.64	0.0	0.41	0.67	0.62	0.06	0.12	0.45	0.08	0.35	0.18	0.26	0.37	0.47	0.44	0.31	0.45	0.72	0.3	0.41	0.38	0.87	0.55	0.23	0.15	0.19	0.54	0.77	0.67	0.31	0.19	0.44	0.26	0.49	0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)